Pcons.net Protein Structure Prediction

Pcons.net Protein Structure Prediction Meta Server

Saturday, April 27 2024

Main Menu

23060 : NP_003097.1 TRANSCRIPTION FACTOR SOX-2 [HOMO SAPIENS]

Your submitted sequence: sequence (317 aa)

Ready methods: PCONS PMODELLER blast ffas pgenthreader rpsblast
Queued locally: lomets itasser hhpred2

blast

Rank	Method Score	Pcons	Pcomb	ProQ2	Template	CATH
1	1e-31	0.151	0.140	0.098	3U2B_C	N/A
2	9e-31	0.160	0.149	0.107	4S2Q_D	N/A
3	3e-30	0.146	0.138	0.108	2GZK_A	N/A
4	1e-27	0.142	0.134	0.103	2YUL_A	N/A
5	5e-27	0.152	0.142	0.104	4A3N_A	N/A
6	5e-09	0.137	0.128	0.094	1WZ6_A	N/A
7	1e-07	0.148	0.139	0.103	2YQI_A	N/A
8	1e-06	0.143	0.139	0.124	2LEF_A	1.10.30.10.6.1
9	4e-05	0.109	0.101	0.069	1CG7_A	1.10.30.10.4.2
10	0.13	0.108	0.099	0.065	2GZK_A	N/A

References

Altschul SF et al (1990) "Basic local alignment search tool." J Mol Biol 215(3), 403-401. [LINK]