Pcons.net Protein Structure Prediction Meta Server Friday, July 19 2019
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© Arne Elofsson

SciLifeLab Logotype nbis Logotype
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23042 : dux4

Your submitted sequence: sequence (424 aa)

Ready methods: PCONS PMODELLER blast ffas pgenthreader rpsblast
Queued locally: lomets itasser hhpred2

PCONS (only used 50 models from 4 methods the score is NOT RELIABLE, models are sorted by Pcomb score)
RankModelMethod ScorePconsPcombProQ2ProQ / ProQresSumTemplateCATHAlignment
1
blast.4
2e-110.1040.1000.086 1FJL_A1.10.10.60.2.1
2
blast.6
5e-100.0990.0960.084 3A02_A3.40.309.10.6.1 1.10.150.20.12.1 3.30.230.10.5.1 3.40.50.1860.3.1 3.30.830.10.2.1 3.40.367.20.1.2 1.10.60.10.2.1 3.40.50.2000.1.1 2.40.170.20.4.1 4.10.450.10.1.1 1.10.300.10.1.1 3.40.309.10.5.1 3.30.497.10.4.2 3.40.309.10.2.1 3.90.25.10.9.1 3.30.360.10.2.1 3.40.50.300.45.1 1.10.300.10.3.2 3.40.47.20.1.1 3.30.160.90.1.1 2.10.50.10.2.1 3.40.50.80.1.1 1.10.10.180.1.1 2.60.40.10.5.1 3.40.190.10.8.1 2.40.50.110.4.1 2.40.10.10.7.2 1.10.12.10.4.1 3.90.260.10.1.2 3.40.50.80.1.3 3.90.1150.10.2.1 1.10.390.10.2.1 2.60.40.10.15.1 2.40.10.10.41.4 2.80.10.50.29.1 2.40.10.10.8.1 3.30.505.10.1.2 3.40.640.10.25.2 3.10.20.90.6.1 2.40.10.10.7.1 1.20.200.10.1.1 3.40.50.1370.1.2 1.10.510.10.2.1 1.10.760.10.18.1 3.40.190.10.8.1 3.30.360.10.18.1 2.40.30.10.7.1 3.40.50.720.27.1 2.140.10.20.1.1 1.10.246.10.2.1 3.40.50.720.20.1 2.70.98.10.9.1 3.40.50.40.2.2 3.30.360.10.2.4 3.90.1150.10.7.4 3.90.440.10.1.1 3.90.110.10.3.1 3.40.50.10240.1.1 4.10.375.10.1.2 4.10.470.10.1.1 2.60.40.10.5.1 1.10.510.10.4.1 3.40.50.10210.1.2 3.30.460.10.1.2 2.30.140.10.1.1 1.20.272.10.2.1 3.40.640.10.36.1 2.60.120.260.11.1 2.60.40.320.2.1 2.60.40.1180.1.1 3.90.25.10.10.1 1.10.340.30.2.1 3.90.1260.10.3.2 2.40.30.10.3.1 3.90.1260.10.1.1 1.20.1090.10.1.1 3.90.260.10.1.4 1.10.238.10.5.1 3.30.360.10.1.1 3.40.50.1400.2.1 2.40.70.10.5.1 3.40.640.10.15.2 3.30.379.10.3.1 2.40.70.10.5.1 1.10.240.10.2.1 1.20.1050.10.2.1 3.40.190.10.40.1 1.10.12.10.4.1 3.30.360.10.2.4 3.30.250.10.1.2 1.10.150.20.7.1 2.60.120.200.8.1 3.40.50.720.20.1 3.40.190.10.7.1 1.10.600.10.4.1 1.10.150.120.1.1 3.30.9.10.3.1 2.170.11.10.1.2 3.40.30.10.59.1 4.10.375.10.1.2 2.40.10.10.80.1 3.40.190.80.3.1 3.40.50.150.41.1 1.10.510.10.25.1 1.10.164.10.1.1 2.40.10.10.7.1 3.40.190.10.72.1 3.30.300.10.3.1 1.10.510.10.2.2 2.60.40.420.5.1 3.30.1180.20.1.1 2.10.70.10.10.1 3.90.226.10.2.1 2.30.30.40.18.1 2.30.30.160.1.1 2.40.10.10.2.1 3.20.20.120.6.1 2.60.40.10.163.1 1.20.1050.10.13.1 2.60.40.420.7.1 2.40.50.140.11.1 3.40.50.1220.1.1 3.40.50.2000.11.1 2.40.170.20.1.1 1.20.1270.50.1.1 1.20.120.330.3.1 2.60.40.320.2.1 2.60.120.10.21.1 2.60.40.30.16.1 2.60.40.1180.17.1 3.40.640.10.12.1 3.30.310.10.2.1 2.60.40.10.5.1 1.20.1270.50.1.1 3.30.70.360.5.1 2.60.120.10.25.1 3.30.360.10.2.5 3.30.70.270.8.1 3.40.50.2030.5.1 3.40.640.10.15.2 1.10.420.10.1.1 2.40.10.10.7.1 2.60.120.260.31.1 2.40.10.10.11.1 2.110.10.10.4.1 3.30.260.10.1.1 3.30.70.270.5.1 2.60.40.10.18.1 3.30.160.60.16.1 3.90.1070.10.1.1 3.40.50.1820.35.1 3.30.70.270.2.1 2.40.50.110.10.1 2.60.40.1180.1.1 3.40.50.790.1.1 2.60.40.10.2.2 2.60.40.1180.1.1 3.20.20.80.35.1 2.60.40.10.2.2 2.40.10.10.69.1 3.20.20.80.2.3 3.30.200.20.5.1 1.10.8.160.1.1 1.20.1050.10.1.2 2.130.10.120.1.1 3.90.1150.10.8.1 1.10.510.10.9.1 2.40.30.10.25.1 2.80.10.50.14.1 3.30.260.10.1.1 1.10.240.10.5.2 3.40.50.2000.1.1 3.30.1540.10.1.1 2.60.40.10.2.1 2.60.40.10.5.1 2.40.70.10.26.1 3.40.50.720.27.1 1.10.1020.10.2.1 1.10.510.10.14.1 1.10.10.370.1.1 1.10.420.10.1.1 2.60.40.10.2.2 1.20.120.230.1.1 2.60.40.10.5.1 3.90.110.10.1.1 3.10.180.20.1.1 1.10.420.10.1.1 3.40.50.2000.1.2 3.40.640.10.19.2 1.10.510.10.2.1 3.40.50.720.105.1 2.40.10.10.1.1 3.90.230.10.4.1 3.90.1150.10.8.1 3.10.450.40.1.1 2.40.30.10.18.1 2.40.10.10.69.1 3.40.47.10.9.1 3.40.50.300.108.1 2.40.10.10.1.1 1.20.1050.10.5.1 3.90.1490.10.1.1 2.80.10.50.3.1 2.80.10.50.14.1 3.40.640.10.19.1 3.10.50.10.2.3 3.90.1600.10.1.1 3.40.50.300.108.1 2.60.40.10.5.1 3.40.20.10.7.1 3.40.50.1220.1.1 3.90.105.10.2.1 2.40.30.10.7.1 2.60.40.10.5.1 2.140.10.30.1.1 3.40.190.10.33.1 3.30.1700.10.1.1 3.20.20.360.1.2 3.90.1420.10.1.1 3.30.360.10.1.1 3.30.420.40.3.1 1.20.1060.10.1.1 2.140.10.30.1.1 3.30.70.270.5.1 3.40.640.10.25.2
3
pgenthreader.7
49.8050.0880.0950.124 2M0C_AN/A
4
pgenthreader.5
50.9120.0870.0940.123 2DMS_AN/A
5
blast.3
2e-110.0980.0940.078 5Z2S_AN/A
6
blast.10
2e-090.0970.0930.078 3CMY_AN/A
7
rpsblast.5
2e-200.0870.0920.114 2DMS_AN/A
8
pgenthreader.8
48.9020.0880.0920.110 2CUE_AN/A
9
rpsblast.7
4e-200.0890.0920.105 1LE8_B1.10.10.60.28.1
10
rpsblast.3
7e-210.0930.0920.088 1FJL_C1.10.10.60.2.1
 
References
Automatic consensus based fold recognition using Pcons, ProQ and Pmodeller. Björn Wallner, Huisheng Fang and Arne Elofsson (2003). Proteins. 53 Suppl 6:534-541.
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Identification of correct regions in protein models using structural, alignment and consensus information. Björn Wallner and Arne Elofsson (2006). Protein Sci., 15(4):900-913.
 
 
© 2006 Stockholm University, Stockholm Bioinformatics Center