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21910 : MADD_wt_755-775res

Your submitted sequence: sequence (23 aa)

Ready methods: PCONS PMODELLER blast dppas dppas2 env-ppas ffas hhpred2 muster pgenthreader ppas rpsblast wdppas wmuster wppas
Queued locally: itasser

PCONS (used 116 models from 13 methods, models are sorted by Pcomb score)
RankModelMethod ScorePconsPcombProQ2ProQ / ProQresSumTemplateCATHAlignment
1
ffas.7
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2
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3
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4
dppas.2
0.1880.3631.065 1O6WA22.20.70.10.5.1 2.20.70.10.3.1
5
dppas2.1
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6
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7
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0.1870.3631.065 1O6WA22.20.70.10.5.1 2.20.70.10.3.1
8
wppas.2
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9
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References
Automatic consensus based fold recognition using Pcons, ProQ and Pmodeller. Björn Wallner, Huisheng Fang and Arne Elofsson (2003). Proteins. 53 Suppl 6:534-541.
Pcons5: combining consensus, structural evaluation and fold recognition scores. Björn Wallner and Arne Elofsson (2005). Bioinformatics., 21(23):4248-4254.
Identification of correct regions in protein models using structural, alignment and consensus information. Björn Wallner and Arne Elofsson (2006). Protein Sci., 15(4):900-913.
 
 
© 2006 Stockholm University, Stockholm Bioinformatics Center