C; An alignment in the PIR format

>P1;pdb1i3q_A.ent
structure:pdb1i3q_A.ent: 2  : A : 1445  :  : : : :
VGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQE-GM-NECPGHFGHIDLAKPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQLV-SRGGCG-NTQPTIRKD---GLKLVGSWKKDRAT---GDADEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLPVPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGV-PKSIAKTL-TY-PEVVT-P-YNIDRLTQLVRNGP-NEHPGAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSP-YNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVS--PQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVIPT-P--AIIKP-KPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKK-TVGSSNGGLIHVVTREKGPQVCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVRFLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDN-TTRN-SLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEKQSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPL-PVNIRRIIQNAQQTFHIDH--TKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQAFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKT-PSLTVYLEPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLQQSPWLLRLELDRAAMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKVP-SPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRA-ALY--KEVYNVIASDGSYVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGAFDVMI*

>P1;pcons23467.1I3Q_A.ffas.9
sequence:pcons23467.1I3Q_A.ffas.9: . : . : . : : : : :
--RE-----A-T--RQPSG----T----------------G--------PEDT-EG--G---R-------HAPELLK--------HQ-----------------L-L-----G---DL---HQ------------E------------------G---P--PLKG----AGG-------KERPG----S-K-----EEVDE-DR---------------D-----------V--DE---------SS-P-----------Q-----D--------S-------------P-PSK----------------A---------------S--P---------A---------QD--G--R-----P--P-------QTAA-----REATSIP---GFPAEG-----------AIP--L--------P-------VD----------------------FL--S--KT-P--G---------S----------SDPLIQ------------P----S----S-----P----AVCPEP--P-------S-----------------------S---P-----KYVSSVT---SRTG--S----SG---A-----------K---EMK------------L-----KGA--D--------------G--------------KT-------K----------IA-------------------------------------T-----------------------------------------------------------------------P--R---GAAPPG-----QK----GQ--------------------ANAT-R-----------------IPA--KTP--------P-------------A-PK---T--------------------PP---------------------SS--------------------GEPP---------K-------SGDRSGY-------------------------------------------------------S-----------S------------P---G------S---PG---------T--P-------------GSRS---R-TP------------------S---L---PT---PPT----R-----------------EP------------K-------------------------------------------------------------------------KV---AVVRT--P--PK-----S-----P-----SS------A--K-----------SR-LQT-APVPM-------P-------------D----L-------KN--VK-S---------KI----------G------S-----------------------*