C; An alignment in the PIR format

>P1;pdb1twf_A.ent
structure:pdb1twf_A.ent: 2  : A : 1450  :  : : : :
VGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQEGMNECPGHFGHIDLA-KPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQLVSRGGCGNTQPTIRKDGLKLVG--SWKKDRATGDADEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLPVP---P--P---PVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPKSIAKTLTY-PEVVT-P-YNIDRLTQLVRNGP-NEHPGAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSP-YNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVS--PQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVIPTPAIIKPKPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKKTVGSSNGGLIHVVTREKGPQVCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVRFLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDT--AVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDNTTRNSLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEKQSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPLPVNIRRIIQNAQQTFHIDHTKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQAFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTVYLEPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLQQSPWLLRLELDRAAMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKVP-SPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDGS--YVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGAFDVMIDEESL*

>P1;pcons23044.1TWF_A.rpsblast.9
sequence:pcons23044.1TWF_A.rpsblast.9: . : . : . : : : : :
-G----------------G-RA-----P-------A-------------QA-------G-G------------------LC--S-AAPG-G--G--H-----------P-A-----P-------S--------------------------------WV---A--------F-----AH---TGAW------------G-------------------------TG----L-P-----AP---HVPCAPGALPQGAFVS--Q--AA------R-----------A---------A--------P--------A--L-----QP----S--Q--A----------------------APA-E--G--I-----------S------QPA---PARGDF-----------AYA--A--------P-------AP----------------------PD--G--AL-S--H---------P----------QAPRWP------------P----H----P-----G----KSREDR--D-------P-----------------------Q---R-----DG----------L---------PG------P-------CA--------------------V--A--------------Q--------------PG-------P----------AQ-------------------------------------A-----------------------------------------------------------------------G--P---QGQGVL-----AP----PT----------------SQGS-------P----------------------W------------------------WG---W--------------------GR---------------------GP--------------------Q--------------------VAGA-------------------------------------------------------A-----------W------------E------------------------PQ-----------------AG---A-AP------------------P---P---QP---APP----D-----------------AS------------A-------------------------------------------------------------------------SA---RQGQM--Q--GI-----P-----A-----PS------Q-----------------------------ALQEPAP--------------------W-SA---------------------------------------------L-------------P----*